bone_2026/condition.txt

209 lines
20 KiB
Plaintext
Raw Permalink Blame History

This file contains ambiguous Unicode characters

This file contains Unicode characters that might be confused with other characters. If you think that this is intentional, you can safely ignore this warning. Use the Escape button to reveal them.

Digital Imaging and Communications in Medicine
— стандарт хранения и передачи медицинских
изображений
DXA / ДРА Двухэнергетическая рентгеновская
абсорбциометрия (денситометрия)
ИИ Искусственный интеллект
ROI Region of Interest — область интереса,
используемая для измерений
MVP Минимально жизнеспособный продукт
AUC Площадь под ROC-кривой
1. Контекст и актуальность задачи
Денситометрия является основным инструментальным методом количественной оценки
минеральной плотности костной ткани и широко применяется для диагностики остеопороза,
оценки риска переломов и динамического наблюдения пациентов. Достоверность результата
зависит не только от работы оборудования, но и от правильности укладки пациента, выбора
исследуемой области, отсутствия значимых артефактов и корректности разметки анатомических
структур.
Ошибки позиционирования и разметки могут приводить к искажению измеряемых
показателей, ошибочной интерпретации динамики и необходимости повторного анализа или
повторного исследования. При этом контроль качества обычно выполняется специалистом
вручную и требует знания критериев корректности для разных анатомических областей.
Применение алгоритмов компьютерного зрения позволяет объективизировать
и стандартизировать контроль качества, автоматически выявлять типовые нарушения
и своевременно сообщать специалисту о необходимости коррекции разметки или повторной
обработки исследования. Такое решение потенциально снижает нагрузку на врача-
рентгенолога и рентгенолаборанта, повышает воспроизводимость измерений и формирует
единый подход к контролю качества денситометрии в медицинских организациях.
Участникам предлагается создать интеллектуальный сервис, который не просто распознаёт
изображение, а выступает цифровым помощником по контролю качества: проверяет, можно ли
использовать исследование для клинической интерпретации, оценивает корректность
нанесённых областей измерения и объясняет, какое именно нарушение обнаружено.
2. Описание задачи
Разработать программное обеспечение на основе искусственного интеллекта для
автоматизированной оценки качества рентгеновских денситометрических исследований и
корректности разметки анатомических структур.
На вход сервис получает денситометрическое исследование в формате DICOM. Решение
должно определить, соответствует ли изображение установленным критериям качества,
корректно ли выполнена разметка, а при наличии нарушения — определить его тип. Основная
задача — обеспечить автоматизированный контроль качества без необходимости первичного
ручного просмотра каждого исследования специалистом.
2.1. Объекты анализа
В базовый контур задачи рекомендуется включить денситометрические исследования
следующих анатомических областей:
• поясничный отдел позвоночника;
• проксимальный отдел бедренной кости.
Допускается разработка единой модели для всех областей либо отдельных
специализированных моделей с автоматическим определением области исследования.
2.2. Основной функционал
• определение анатомической области и проекции исследования;
• классификация исследования как качественного или содержащего нарушение качества;
• оценка корректности укладки и позиционирования пациента по стандартным критериям;
• оценка корректности разметки анатомических структур и областей измерения;
• определение одного или нескольких типов нарушения качества;
• формирование структурированного отчёта с результатами работы.
2.3. Перечень оцениваемых нарушений
От решения требуется рассматривать следующие категории:
1. Поясничный отдел позвоночника
• корректная укладка (на нижнем уровне сканирования визуализированы верхние края
подвздошных костей, верхний уровень — половина тела позвонка Th12)
2.4. Входные данные
• Исследования в формате DICOM без разметки.
• Одно исследование может включать одно или несколько изображений/серий
(не более 3).
• Метаданные DICOM могут использоваться моделью, однако решение не должно зависеть
от наличия персональных данных.
• Организатор предоставляет обезличенные изображения и часть исследований
с экспертной разметкой.
3 см
и более
2 см
и более
3 см
2.5. Требования к выходным данным
Решение должно формировать итоговый файл в формате .xlsx или .csv. Одна строка
соответствует одному изображению (одна анатомическая область) в исследовании.
Рекомендуемая структура:
Название колонки Описание Формат
path_to_study Путь к исследованию или файлу String
study_uid Идентификатор исследования из
DICOM-тегов String
image_uid Идентификатор изображения из
DICOM-тегов String
anatomical_region Определённая анатомическая область String
quality_class 0 — качественное, 1 — есть нарушение Integer
violation_type Тип или перечень нарушений String
processing_status Success / Failure String
time_of_processing Время обработки в секундах Float
2.6. Дополнительный функционал
• Дополнительная серия с визуализацией обнаруженного нарушения на изображении:
маска, контур, ключевые точки или тепловая карта.
• Текстовое описание выявленных нарушений в формате DICOM SR.
• Автоматическая коррекция разметки с возможностью подтверждения специалистом.
• Интерактивный веб-интерфейс для загрузки, просмотра и пакетной обработки
исследований.
2.7. Технические требования
• Время обработки одного исследования: не более 3 минут на целевой конфигурации.
• Отсутствие необработанных исключений; все ошибки фиксируются в отчёте.
• Воспроизводимость результатов при повторном запуске на одинаковых данных.
• Возможность пакетной обработки исследований из архива с предоставлением общей
таблицы (xlsx/csv) в качестве результата обработки, а также zip-архива с дополнительными
сериями (при наличии функционала)
3. Программно-аппаратные требования
3.1. Аппаратные требования
Специальные аппаратные ограничения не предъявляются при условии выполнения
функциональных и нефункциональных требований. Участник должен указать минимальную
и рекомендуемую конфигурацию для инференса: объём оперативной памяти, требования
к процессору и графическому ускорителю, объём дискового пространства.
Конфигурация оборудования, на котором будет проводиться финальное тестирование:
2 × H200 141 GB, каждая H200 в своей виртуальной машине c флейвором GPU-44-256-H200-1
(44 CPU, 256 RAM, 141 VRAM).
3.2. Программные требования
• Выбор языка программирования, библиотек машинного обучения и архитектуры решения
остаётся на усмотрение участников.
• Обязательна контейнеризация решения.
• Участники должны предоставить скрипт для сборки и запуска контейнеризированного
приложения в Linux и UNIX-подобных системах.
• Решение должно запускаться локально без обращения к внешним закрытым сервисам
и без передачи медицинских изображений во внешние системы.
• Должен быть реализован API для пакетной обработки тестового набора данных.
• Все используемые зависимости, включая версии библиотек, сред выполнения и базового
контейнера, должны быть зафиксированы.
4. Требования к презентации/демонстрации
Презентация должна показать не только итоговые метрики, но и логику клинического
контроля качества. Команде необходимо продемонстрировать:
• описание и обоснование выбранного подхода;
• архитектуру модели и программного решения;
• состав наборов данных, правила разбиения выборки и методы предобработки;
• таксономию нарушений качества и подход к исследованиям с несколькими нарушениями;
• результаты экспериментов, сравнение вариантов модели и анализ ошибок;
• метрики качества с доверительными интервалами;
• скорость обработки и системные требования;
• ограничения решения и сценарий дальнейшего внедрения;
• кейсы, демонстрирующие работу решения.
• описание структуры проекта;
• системные требования и перечень зависимостей;
• инструкцию по сборке и запуску контейнеризированного приложения;
• описание реализованного API;
• описание формата входных и выходных данных;
• описание модели, предобработки и постобработки;
• перечень известных ошибок и способы их обработки.
Дополнительно предоставляются руководство пользователя, руководство
по развёртыванию и краткое описание процедуры обучения или дообучения модели.
6. Ресурсы
• Обезличенные медицинские изображения денситометрии в формате DICOM
с экспертной оценкой качества (НД_для_обучения.zip).
• Описание критериев качества и примеры корректной разметки — можно детальнее
изучить в методических рекомендациях в разделах 2.6, 2.7.
• Фрагмент данных для проверки формата и отладки загрузчика (Для теста.zip).
• Закрытый тестовый набор для финальной оценки, не передаваемый участникам.
7. Требования к сдаче решений
7.1. Требования для промежуточной сдачи решения
Промежуточная сдача предусматривает предоставление MVP, включающего:
• обученную модель и скрипт инференса;
• модуль чтения DICOM и пакетной обработки;
• определение как минимум бинарного класса «качественное / есть нарушение»;
• оценку корректности разметки для как минимум одной анатомической области;
• файл с результатами в согласованном формате;
• расчёт основных метрик на валидационной выборке;
• краткая инструкция по работе с моделью;
• описание текущих ограничений и план доработки
• поддержку всех обязательных анатомических областей и классов нарушений,
утверждённых организатором;
• скрипт для сборки и запуска контейнеризированного приложения; инструкция
по запуску скрипта в Linux и Unix-подобных системах;
• устойчивую пакетную обработку закрытого тестового набора;
• структурированный файл результатов;
• полный комплект документации;
• презентацию и демонстрационный сценарий;
• исходный код либо иной комплект материалов в объёме, установленном правилами
конкурса.
Финальная проверка проводится экспертами на закрытых данных без участия команды.
Расчёт итоговых метрик выполняется на стороне организатора.
8. Критерии оценки
8.1. Подход коллектива к решению задачи
Оцениваются понимание клинической задачи, обоснованность таксономии нарушений,
подход к формированию обучающей выборки, работа с дисбалансом классов и предотвращение
утечки данных между обучающей и тестовой выборками.
8.2. Техническая проработка решения
Оцениваются архитектура модели, качество предобработки DICOM, корректность работы с
изображениями, устойчивость программной реализации, обработка ошибок, контейнеризация,
воспроизводимость работы.
8.3. Соответствие решения поставленной задаче
Оцениваются полнота выполнения обязательных функций, соответствие форматов входных
и выходных данных, поддержка заявленных анатомических областей, прозрачность ограничений
и пригодность решения для локального использования
• сбалансированная точность и F1-мера;
• ROC AUC и/или PR AUC для бинарной классификации;
• macro-F1 для многоклассового или мультилейбл-определения типов нарушений;
• метрики локализации или сегментации — Dice, IoU, расстояние между ключевыми точками
— при наличии соответствующего функционала;
• время обработки одного исследования и доля успешно обработанных файлов.
Приоритетной клинической характеристикой являются F1-мера и ROC-AUC,
как сбалансированные метрики работы решения. Метрики диагностической точности
желательно представлять с 95% доверительными интервалами.
8.5. Выступление коллектива на питч-сессии
Оцениваются владение материалом, способность объяснить клиническую и техническую
логику решения, качество демонстрации, аргументированность выбранных подходов, понимание
ограничений и реалистичность плана пилотирования и внедрения